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對于自閉癥兒童的有效治療手段主要是綜合治療和干預(yù)。綜合治療和干預(yù)的方法包括：對患兒父母親的咨詢和指導(dǎo)、行為矯正、特殊教育、感覺統(tǒng)合訓(xùn)練和藥物治療。

兒童自閉癥生物療法可信嗎？在治療過程中，要具有系統(tǒng)生物學(xué)的觀點看待治療。實際上，自閉癥是一種不可能完全治好的疾病，但是，早期及干預(yù)方法正確對患兒一定是有幫助的。所以，體現(xiàn)在系統(tǒng)生物學(xué)上的觀點包括在預(yù)測性、預(yù)防性、個體化和參與性四個方面。個體的健康不僅是沒有疾病，而且是一種積極的活力狀態(tài)，能夠使個體的生命發(fā)揮出他的全部潛能。通過兼顧基因、環(huán)境、代謝、免疫，兼顧局部與全身，兼顧生物學(xué)與社會文化來體現(xiàn)在個體中的平衡去發(fā)揮作用。

50-70％的自閉癥兒童會采用生物相關(guān)療法，雖然大多缺乏完整有效的安全性和有效性評估，即使其中某些效果比較好，也仍需更多的系統(tǒng)性的研究和評估。隨著對人體微生物和自閉癥的關(guān)系研究發(fā)展，相關(guān)的治療方法，如食物干預(yù)、益生菌、糞菌移植等，逐步顯示出安全性和有效性，是具有廣泛應(yīng)用前景的生物治療方法。